Vyzkoušejte volně přístupný on-line učební modul, který vás naučí vše o fragmentech pro kontrolu kvality: jak fungují, jak je interpretovat a jak zajistit, aby vaše MLPA splňovala požadavky na kvalitu.
Modul popisuje, jak interpretovat fragmenty kvality a to jak v profilu MLPA píků, tak za použití Coffalyser.Net. Každý MLPA kit totiž obsahuje fragmenty pro kontrolu kvality, které jsou zásadním nástrojem při hodnocení vašich MLPA experimentů a jejich možných problémů.
Označením CE u kitů P033 CMT1, P405 CMT1 a P140 HBA
Kity P033 a P405 pro Charcot-Marie-Tooth chorobu a P140 pro alfa thalasémii (zahrnující vzorek DNA SD031) nesou nyní označení CE pro použití v in vitro diagnostice (IVD) v zemích EU a země ESVO. Ve všech ostatních zemích jsou tyto produkty prodávány pouze pro výzkumné účely (RUO).
Pomozte nám najít vzorky s MECP2 aberacemi
MRC-Holland v současné době hledá vzorky s odchylkou v genu MECP2, konkrétně:
- ženské vzorky s heterozygotní delecí MECP2
- mužské vzorky s duplikací MECP2
Máte takové vzorky k dispozici a chcete je MRC-Holland poskytnout? Kontaktujte nás. My vám výměnou poskytneme slevu na kity (bez činidel). Upozorňujeme, že potřebujeme pouze omezený počet vzorků.
Co jste možná nevěděli
- MLPA nelze použít u vzorků z celogenomové amplifikace (WGA), protože WGA neamplifikuje každou genomovou sekvenci se stejnou účinností. WGA způsobuje kolísání relativní přítomnosti oblastí genomu, což se projeví ve změněných poměrech ve výsledcích MLPA.
- DNA jedné diploidní lidské buňky má váhu 6 pg (1 pikogram = 10-12 g). Pro MLPA budete potřebovat 50-100 nanogramů DNA, to je přibližně DNA obsah z 10 000 diploidních buněk.
- Z tohoto důvodu MLPA nelze použít na jednotlivé buňky, a proto není vhodná pro preimplantační diagnostiku.
Prognostické biomarkery u Wilmsova nádoru
Díky účinné kombinaci chirurgie, chemoterapie a radioterapie se celková míra přežití pacientů s Wilmsovým nádorem (WT), což je nejčastější pediatrický nádor ledvin, zvýšila na více než 90 %. Ale jen polovina dětí trpící nádorovým relapsem přežije. Proto potřebujeme specifické biomarkery pro výběr léčby.
Nedávná studie SIOP použila kit P380 pro skríning téměř 600 vzorků od WT pacientů, aby posoudila status počtu kopií 1q. Zjistila, že 1q zisk byl významně spojen s nepříznivým „event-free“ a celkovým přežitím u WT. MLPA se ukázala být účinná a rychlá metoda pro stanovení statusu počtu kopií asociovaných s horším přežitím bez klinické příhody. Zisk MYCN, ztráta TP53 a FBXW7, vše detekované pomocí MLPA, jsou také slibné nepříznivé prognostické ukazatele pro WT. Díky optimalizaci léčby s menšími vedlejšími účinky pomocí molekulárních markerů ještě více dětí přežije WT a může žít zdravější život.
Elektrochemická detekce nádorových biomarkerů a MLPA
MRC-Holland ve spolupráci s několika evropskými laboratořemi použil MLPA sondy pro detekci 7 mRNA markerů spojených s rakovinou prsu. Místo separace fragmentů na kapilární elektroforéze byly produkty MLPA detekovány elektrochemicky. MLPA sondy byly navrženy tak, aby obsahovaly sekvenci s jedinečným čárovým kódem.
- Zachycené sondy komplementární ke každé sekvenci s čárovým kódem byly imobilizovány na každou elektrodu v levném mikročipu s elektrodami, který je vyráběný jako standardní substrát s tištěnými spoji (PCB).
- Elektrody byly inkubovány s jednovláknovými produkty MLPA, po hybridizaci byla přidána křenová peroxidáza konjugovaná se sekundární sondou komplementární k amplifikovanému vláknu a vytvořil se genokomplex, který byl elektrochemicky detekován, a to přidáním substrátu pro peroxidázu.
- Mikročipy vykazovaly vynikající elektrochemický výkon, který odpovídá planárním fotolitografickým zlatým elektrodám, ale umožňují obrovské snížení nákladů (> 50 krát nižší na array).
- Bylo prokázánoi, že optimalizovaný systém je vysoce specifický se zanedbatelnou křížovou reaktivitou, což umožňuje současnou detekci sedmi mRNA markerů s detekčním limitem až 25pM. Tento přístup poskytuje novou strategii pro genetické profilování nádorových buněk pomocí integrované "amplifikace-detekce".
MRC-Holland zatím nenabízí žádný produkt založený na této nové technologii. Výzkum se zaměřuje na další vývoj technologie digital MLPA, ve které je MLPA kombinována s Illumina sekvenačními přístroji (viz květnové číslo MLPA zpravodaje).
| Nové kity | Vylepšené kity |
|---|---|
|
|
Blížící se konference
| 18.-22. říjen | Vancouver, Kanada | ASHG (ASHG), stánek#412 |
| 8.-12. listopad | Charlotte, NC, USA | AMP (AMP), stánek #412 |
| 3.-6. prosinec | San Diego, CA, USA | ASH (ASH)* |
* MRC-Holland nemá stánek na ASH; můžete nám poslat email a sjednat si s námi schůzku
Semináře
| Duben 2017, okolo AMP Global Kongresu | Berlín, Germany | Otevřen pro registraci |
| Květen 2017, před ESHG | Kodaň, Dánsko | Otevřen pro registraci |