Epigenetika zkoumá změny ve strukturách a funkcích nukleových kyselin, a to především DNA, přičemž strukturu DNA nijak dále neovlivňují sledem nukleotidů. Tyto změny jsou navíc pouze dočasné, ale za to přenosné mezi generacemi. Změny zkoumané epigenetikou se týkají nukleotidů jako takových a zároveň také bílkovinného nosiče DNA, tedy histonů.
Princip zkoumání epigenetických změn
V prvé řadě jsou modifikovány některé baze, v DNA je to cytosin (methycytosin, hydroxymethylcytosin), a dále také histony, u nichž je škála modifikací poněkud pestřejší (metylace, acetylace, a další). Modifikace určitých funkčních míst v molekulách nukleových kyselin mají různý význam, podobně jako existuje nenáhodný výběr cílových míst modifikací u jednotlivých bazí a jejich sekvencí. Kupříkladu genovou transkripci mohou ovlivňovat modifikace v oblasti promotorů a popřípadě dalších regulačních sekvencí.
Jak lze epigenetické změny uplatnit pri karcinogenezi
Epigenetické změny mohou mít na lidskou patologii zásadní, neboť je lze uplatnit při karcinogenezi, a to například:
- potlačením činnosti genů zapojených do opravných procesů nukleových kyselin
- potlačením kontrolních bodů buněčného cyklu,
- potlačením systému programované buněčné smrti
Některé epigenetické změny mohou být přeneseny spermiemi nebo vajíčkem do zygoty a stanou se tak příčinou dědičných poruch. Tímto způsobem mohou být mezigeneračně přeneseny i modifikace, ke kterým došlo působením vnějších vlivů.
Metody zkoumání epigenetických změn v lékařské genetické diagnostice
Epigenetické změny se často zkoumají i při lékařské genetické diagnostice, a to primárně 2 níže uvedenými způsoby. Berte však na vědomí, že obě tyto metody vyžadují přesné doladění. Jejich výsledky jsou převážně kvantitativní a ne všechna modifikovatelná místa jsou skutečně modifikována.
- Testování štěpitelnosti DNA pomocí dvou restrikčních enzymů - starší, avšak stále hojně využívaná metoda, restrikční enzymy se liší ve schopnosti štěpit cílová místa, v nichž se vyskytuje methylovaná báze (kupříkladu methyl-cytosin).
- Chemická přeměna methyl-cytosinu působením bisulfátu - bisulfát deaminuje pouze nemethylovaný cytosin, vždy jen restrikční enzymyutno vycházet z porovnání dvou způsobů zpracování vzorku
| Katalogové číslo | Název produktu | Množství | Cena v Kč bez DPH | Cena v Kč s DPH |
| K1441 | EpiJET™ DNA Methylation Analysis Kit (MspI/HpaII) | 200 react | 3098 | 3748 |
| K1451 | EpiJET DNA Methylation Analysis Kit (TaqI/HpyF30I) | 200 rxn | 3098 | 3748 |
| K1461 | Bisulfite Conversion Kit | 50 rxn | 4048 | 4898 |
| K1481 | EpiJET 5-hmC Analysis Kit | 25 rxn | 5843 | 7070 |
| K1031 | Luminaris Color HRM Master Mix | 250 x 20 µL rxns | 5702 | 6900 |
| K1032 | Luminaris Color HRM Master Mix | 1,250 x 20 µL rxns | 23302 | 28196 |
| ER2211 | SgeI | 250 units | 7603 | 9200 |
| EM0821 | CpG Methyltransferase (M.SssI) | 250 units | 4576 | 5537 |
| SD1111 | Jurkat Genomics DNA | 15 µg | 1866 | 2257 |
| SD1121 | CpG Methylated Jurkat Genomic DNA | 15 µg | 7322 | 8859 |
| SD1131 | CpG Methylated Human Genomic DNA | 15 µg | 7322 | 8859 |