
Pár tipů pro efektivnější práci v leboratoři:
- Není vhodné prodloužení denaturace vzorku DNA, ačkoliv starší MRC-Holland dokumenty to doporučovaly jako způsob, jak zlepšit denaturaci. Prodloužení kroku denaturace DNA totiž způsobuje depurinaci.
- Pro zvýšení denaturace doporučujeme snížit množství vzorku DNA nebo přečištit DNA.
- FFPE DNA je často depurinovaná.
- Sondy, které se skládají ze tří částí - pravé oligo sondy, překryvné oligo a levé oligo sondy jsou mnohem citlivější na depurinaci. Používají se k identifikaci některých komplikovaných oblastí (např. V P081/P082 NF1) a jsou vždy jasně označeny v popisu výrobku.
Celiakie - rychlá detekce 3 rizikových genotypů
Pro celiakii je důležitá genotypizace HLA-DQ2.2, HLA-DQ2.5 a HLA-DQ8. Nepřítomnost těchto tří genotypů má totiž silnou negativní prediktivní hodnotu. Ve spolupráci s několika nizozemskými nemocnicemi MRC-Holland navrhlo a testovalo nový test MLPA pro kombinovanou detekci HLA-DQ2.2, HLA-DQ2.5 a HLA-DQ8. Směs MLPA sond byla ověřena na souboru 59 vzorků, které byly charakterizovány běžnými technikami, včetně PCR-SSCP/HD nebo PCR-SSO a PCR-SSP.
Test MLPA genotypizoval všechny vzorky správně, což ukazuje 100% shodu ve srovnání s výsledky získanými jinými technikami. MLPA tak poskytuje spolehlivou analýzu rizikových genotypů celiakie HLA-DQ2.2, HLA-DQ2.5 a HLA-DQ8 v rámci jedné reakce a umožňuje stratifikaci nebo vyloučení rizika onemocnění.
Další novinky z MRC-Holland
-
CE označení kitu P062 LDLR - kit nyní můžete používat jako in vitro diagnostický (IVD) test v zemích uvedených na Osvědčení o analýze za podmínek uvedených v popisu výrobku. Ve všech ostatních zemích je produkt určen pouze pro výzkumné účely (RUO).
-
Nová verze P003 se speciálním binning vzorkem DNA - rekurentní 10 Mb inverze na chromozomu 2p může být detekována s novou D1 verzí P003 MLH1/MSH2 kitu. CE označená SD052 Binning DNA, která je součástí každé zásilky kitu, může být použita pro „binning“ 2 nových sond specifických pro inverzi.
Těšíme se na setkání na seminářích a konferencích
Konference
- 3.-7. 4., Kjóto, Japonsko - ICHG
- 23.-24. 4., Atény, Řecko - IBFM-SG
- 25.-26.4., Atény, Řecko - CLS
- 21.-24. 5., Barcelona, Španělsko - ESHG
- 25.-28. 5., Moskva, Rusko - SIOP Asia on Medical Events
MRC-Holland nadále organizuje jednodenní MLPA workshopy.
Semináře
- Kjóto a Tokio, Japonsko (duben, volná místa)
- Barcelona, Španělsko (20. května, před konferencí ESHG, kapacita téměř naplněna)
- Moskva, Rusko (25. května, před SIOP Asia, kapacita téměř naplněna)
Tyto semináře jsou organizovány ve spolupráci s místními partnery: Falco (JP), Genycell (ES), Biochemmack (RU).
Nové MLPA kity
- P471 EOFAD (Early-Onset Familial Alzheimer's Disease)
- ME012 MGMT-IDH1-IDH2 (Gliomas)
- P073 IKBKG (Incontinentia Pigmenti)
Vylepšené kity
- P411 Porphyria mix 1 (Porphyrias)
- P003 MLH1/MSH2 (Lynch syndrome)
- P200 Reference-1 (Synthetic 'home-made' probes)
- P222 LCA mix-2 (Leber congenital amaurosis)
- P304 IRF6 (Van der Woude syndrome)
- P153 EYA1 (Branchio-oto-renal dysplasia syndrome)
- P028 FHL (Familial hemophagocytic lymphohistiocytosis)