RNA-Seq (sekvenování transkriptomu) se používá pro kvantifikaci transkriptomu (soubor všech RNA) a strukturní analýzy. Analýza transkriptomu je základem pro výzkum struktury a funkce genů. RNA-Seq poskytuje objektivní informace o transkriptomu pro základní a lékařský výzkum, farmakogenomiku a vývoj léčiv.
RNA-Seq, na rozdíl od čipů, nevyžaduje předchozí znalosti genomu, a proto nabízí následující aplikace:
- identifikace nových transkriptů
- identifikace alternativně sestřižených transkriptů
- studium polymorfismů transkriptomu
- detekce fúzních genů